Εκτός από την αναστολή της ανάπτυξης και της αναπαραγωγής μικροοργανισμών, η αποοξυγόνωση υπό κενό έχει μια άλλη σημαντική λειτουργία για την πρόληψη της οξείδωσης των τροφίμων. Επειδή τα λιπαρά τρόφιμα περιέχουν πολλά ακόρεστα λιπαρά οξέα, οξειδώνονται από τη δράση του οξυγόνου, γεγονός που κάνει το φαγητό να έχει άσχημη γεύση και να χαλάει. Επιπλέον, η οξείδωση προκαλεί επίσης απώλεια της βιταμίνης Α και της βιταμίνης C και οι ασταθείς ουσίες στο χρωματισμό των τροφίμων επηρεάζονται από το οξυγόνο για να σκουρύνουν το χρώμα. Επομένως, η αποοξυγόνωση μπορεί να αποτρέψει αποτελεσματικά την αλλοίωση των τροφίμων και να διατηρήσει το χρώμα, το άρωμα, τη γεύση και τη θρεπτική τους αξία.
